Lo Statuto del Comune di Santa Margherita Ligure prevede tre commissioni consiliari permanenti il cui funzionamento è disciplinato dal Regolamento per il funzionamento del Consiglio Comunale

Il Consiglio è un organo collegiale ed elettivo che rimane in carica per 5 anni.

La Giunta Comunale è uno degli organi di governo del comune, ed è composta dal sindaco, che la presiede e dagli assessori che includono il vicesindaco.